傅里叶红外光谱仪的工作适应性十分强，而且检测范围十分广泛，它可以进行多种复杂的检验测试，从相关技术资讯中了解到普通的光谱仪器对于光照和其他条件变化十分敏感，虽然该器对于其他光斑也要酌情规避，但是可以尽量的消除环境变化带来的数据变化，那么傅里叶红外光谱仪的信号被覆盖后如何处理呢，下面我们来仔细说说。
1.改变激发激光的波长
有时改变波长是十分可行的避免荧光干扰的方法，但对用可见光激发的系统则不然，但将激发波长移至紫外或近红外区域很可能解决或减少此类问题。如果实验室有太多的室内光源比如荧光、白炽灯或日光灯等，这会在测试光谱上出现不必要的背景信号，因此在傅里叶红外光谱仪测试的时候应将室内光关闭，或用遮光罩将样品台罩住以避免外界的杂散光进入光谱仪。
2.猝灭
一些发荧光或磷光的样品在测量时会给出非常高的背景光谱，但这只是样品材料的本征性质，是激光辐照下无法避免的结果，一些样品可采用测试前将激光辐照在表面一段时间，对荧光进行猝灭可以减小荧光光谱的背景增强拉曼信号。仪器猝灭的时间根据样品不同可从几分钟到几小时。值得注意的是：猝灭效应呈指数衰减，一开始就可观察到。
3.共焦模式
通常情况下傅里叶红外光谱仪信号更强，尽管这样仍可采取一些措施减少或减轻荧光副作用。采用共焦模式测量强光下辐照的小体积样品时荧光将会大大降低，*的仪器厂家称该法也同样适合有荧光衬底的样品，例如被荧光物质基体包裹的样品，但是具体操作时可能会有所区别。
