使用强溶剂冲洗色谱柱对内部填料的损伤是zui大的，尤其是纯水，除非你的色谱柱是耐水的。冲洗色谱柱的方法是用流动相比例的水系和有机系来冲洗。如果认为流动相比例无法把色谱柱冲洗干净或者此比例中有机系占有比例过大，可以使用内含10%左右的纯水来冲洗。

　　对于色谱柱的污染，*的就是筛板，因此我们zui常用的做法就是把柱头卸下来，把筛板拿去超声清洗。但是我们在拆卸过程中对色谱柱前端填料的损害远远大于污染照成的伤害，因此建议这一步能不做就不做。

　　液相色谱柱是消耗品，会随使用时间或进样的次数增加，出现色谱峰高降低，峰宽加大或出现肩峰，柱效下降。需要定期进行*清洗和再生。

　　1.反相柱

　　分别用甲醇：水=90：10、纯甲醇、二氯甲烷等溶剂着流动相，依次冲洗，每种流动相流经色谱柱不少于20倍的色谱柱体积。然后再以相反的次序冲洗。

　　2.正相柱

　　分别用正己烷、异丙醇、二氯甲烷、甲醇等溶剂做流动相，顺次冲洗，每种流动相流经色谱柱不少于20倍的柱体积(异丙醇粘度大，可降低流速，避免压力过高)。注意使用溶剂的次序不要颠倒，用甲醇冲洗完后，再以相反的次序冲洗至正己烷。所有的流动相必须严格脱水。

　　3.离子交换柱

　　长时间在缓冲溶液中使用和进样，将导致色谱柱离子交换能力下降，。用稀酸缓冲溶液冲洗可以使阳离子柱再生，反之，用稀碱缓冲溶液冲洗可以使阴离子柱再生。

　　用户还可以选择能溶解柱内污染物的溶剂为流动相做正方向和反方向冲洗。但再生后的色谱柱柱效是不可能恢复到新柱的水平的。